«Граждане каждой страны отличаются друг от друга наличием тех или иных бактерий и их численностью. До недавнего времени приходилось анализировать микрофлору россиян на основе данных из других стран, так как сведений о микробиоме нашей страны не было. Мы исправили эту ситуацию», — привели в пресс-службе слова младшего научного сотрудника кафедры генетики и биотехнологии СПбГУ Лаврентия Данилова.
Анализ бактериальной флоры назначают при инфекциях, чтобы точно определить патоген и начать прицельную терапию. Установить возбудителя стандартными методами, например, с помощью бакпосева или ПЦР, получается не всегда. В таких случаях врачи прибегают к метагеномному секвенированию — анализу микробного сообщества в биологических материалах на основе определения выделенной из образца последовательности ДНК.
Разработка — программа Antimicro, которая обрабатывает загруженные пользователем данные, а затем формирует заключение. В нем отражаются сведения о том, сколько бактерий и каких видов содержится в образце, какой у них уровень антибиотикорезистентности.
Antimicro полностью на русском языке, также в программе есть подробная инструкция, чтобы даже неопытный пользователь смог разобраться во всех ее функциях. Кроме основного модуля для анализа метагенома, разработчики предусмотрели несколько дополнительных — справочник микроорганизмов и лекарственных средств, отдельный раздел для подбора терапии.
Как отметили в университете, ученые СПбГУ нацелены получить на программу сертификат соответствия в Министерстве здравоохранения РФ. Это значительно расширит возможности пациентов, и исследование можно будет сделать не только на платной основе, но и по ОМС. На сегодня сертификата нет ни у одного подобного продукта.
Аntimicro пригодится во многих медицинских направлениях. У врачей появится возможность спасать больше жизней и снижать проявления тяжелых хронических заболеваний, связанных с изменениями в микробиоме и приводящих к инвалидизации. Также программа будет полезна в фармакологии, экологии, биотехнологии, сельском хозяйстве и пищевой промышленности.
